目前，全國性擔保公司的監管機制並不完善。註冊資本1億元以上的擔保公司由中央工信部監管，其他由地方政府機構監管。各地情況不壹樣，上級監管部門也不壹樣，中小企業局，經貿委，財政局，財政局。
此外，大多數地方協會都是社區組織，政府成立的協會很少。因此，協會沒有實權，大多為擔保公司提供技術支持，組織地方評級和學習交流平臺，不具備監管權力和責任。