兩者的區別在於:
本章程適用於組織和社團規定的組織規則。它們是公司組織結構、內部關系和經營活動的基本規則和依據，是公司設立所必需的法定條款。
業務章程適用於單位行使業務職權時制定的規則，壹般包括業務範圍、業務開展條件、業務運作方式和原則等。