1.1993 -1997:中國長江航運集團南京油輪有限公司
2.1997 -2004:南京油輪有限公司
南京企業有限公司
2016南京油運有限公司重組，更名為招商局南京海運有限公司，本次重組的目的是加強公司與招商局集團的關系，提高業務競爭力。因此，從2016起，招商局南油正式成為招商局集團的子公司。