南航在新疆、華北、北京、深圳、海南、黑龍江、吉林、大連、河南、湖北、湖南、廣西、珠海設有分公司，在廈門、汕頭、貴州、珠海設有4家控股子公司。
東航有雲南、河北、山東、西北、江蘇、寧波、甘肅、安徽、北京、武漢。