海南金石源小額貸款有限公司沒有在相關部門註冊，所以是非法機構。根據相關法律法規和監管要求，無證貸款公司的行為是違法的。這意味著，海南金石源小額貸款有限公司提供的貸款雖然存在，但並不合法有效。由於其違法性質，公司的貸款不會上報征信機構，也不會對個人信用記錄產生影響。因此，海南金石源小額貸款有限公司的貸款不會出現在個人信用報告中。