1.主營業務不同:證券公司是提供證券經紀和證券交易服務的金融機構。其主要業務包括股票、債券、基金、期貨等證券的交易和承銷，證券投資咨詢、資產管理等業務。基金公司是專門管理投資基金的金融機構。其主要業務包括基金募集、管理、銷售和贖回。
2.客戶不同:證券公司是經證券監管部門批準設立的，主要客戶是個人投資者和機構投資者。基金公司是經基金業監管機構批準成立的，主要服務對象是投資者。