三人公司，壹個股東占48%的股份，怕是另外兩個共同做出不利於那個股東的決議。可以在章程中設置“壹票否決”嗎？

妳的目標不是通過。妳可以在章程中規定，重大決策需要2/3以上股份的同意。2/3這個數字指的是上市公司章程，三人公司只能算是合夥企業。具體要咨詢公司法或者咨詢專業人士。