廈航和南航在股權上有壹定關系，是兩家獨立的公司。廈航成立於1984，總部位於福建省廈門市。南航成立於1987，總部位於廣東省廣州市。雖然南航持有廈航55%的股份，兩家公司之間也存在合作關系，在部分業務上實現了資源共享等優勢互補，但從法律上講，仍然是獨立經營、自負盈虧的企業。