阜陽市教育局有內設機構:
首先，辦公室:
協助管理部門的日常工作，協調各部門之間的工作關系；負責文電、會議、機要、信訪和檔案管理；負責綜合性稿件的起草；承擔信息、監察保密、政務公開和電子政務工作。
二、人事科:
統籌全市教育系統各級各類學校教師隊伍建設；指導教育系統人事、勞動工資管理和人事制度改革；負責局機關、直屬事業單位和直屬學校的機構編制、薪酬、人事管理及相關人事制度改革工作。
三。規劃和財務科:
擬定全市教育發展規劃和年度計劃並監督實施；規劃和指導全市學校布局結構調整的相關工作，制定全市普通中學招生計劃和高中階段教育指導性招生計劃。
教育局的職責:
(壹)貫徹執行黨和國家教育體育工作的方針、政策、法律、法規和規章。
(二)制定全市教育體育體制改革配套政策和教育體育事業發展規劃，負責各級教育體育的統籌規劃和協調管理，指導各級各類學校教育教學改革和中小學布局結構調整。
(三)負責義務教育的指導和協調，推進全市義務教育均衡發展，促進教育公平；指導普通高中教育、學前教育和特殊教育；推進基礎教育教學改革，全面實施素質教育。
(四)統籌和指導全市教育督導工作，負責組織和指導中等及中等以下教育和掃除青壯年文盲的監督、檢查、評估和驗收，指導基礎教育發展水平和質量的監測。
(五)指導以就業為導向的職業教育發展和改革，指導中等職業教育教材建設和職責。