1928年3月16日：依據敕令第30號成立。設置文政學部、理農學部與附屬圖書館。在文政學部，設立哲學科、史學科、文學科、政學科等四個學科。在理農學部，設立生物學科、化學科、農學科、農藝化學科。在文政學部，設立國語學?國文學、東洋史學、哲學?哲學史、心理學、土俗學?人種學、憲法、行政法等講座。在理農學部，設立植物學第壹（植物分類及生態學）、動物學第壹（水產動物學、比較生理學）、地質學第壹（地質學、地史學、古生物學）、化學第壹（物理化學）、生物化學、植物病理學等講座（敕令第33號）。
1928年4月1日 文政學部與理農學部開課。在理農學部，設置附屬植物園、附屬農場。合並臺北高等農林學校，在那裏設立附屬農林專門部。在文政學部，增設東洋倫理學?西洋倫理學、西洋文學、經濟學、民法?民事訴訟法、刑法?刑事訴訟法等講座。在理農學部，增設氣象學、農藝化學第壹（土壤肥料學）、應用菌學、昆蟲學?養蠶學等講座。文政學部***開設12個講座、理農學部10個講座（敕令第49號）。
1928年12月26日：為了準備擴充1929年度的開課講座，在文政學部增設四個講座、理農學部9個講座（敕令第287號）。在文政學部，增設南洋史學、東洋哲學、教育學?教育史、政治學?政治史等講座。在理農學部，增設植物學第二（植物生理學）、數學、物理學、化學第二（有機化學）、農學?熱帶農學第壹（農業經濟學）、農學?熱帶農學第二（園藝學）、農藝化學第二（農產利用學、食品制造學）、農產制造學?制糖化學、農業工學等講座。
1929年4月10日：增設文政學部四個講座、理農學部壹個講座，各學部擴充為20個講座（敕令第60號）。在文政學部，增設東洋文學、國史學、法律哲學、經濟學第二講座。在理農學部增設動物學第二（比較形態學、哺乳動物學）講座。
1930年2月26日：為了準備擴充1930年度的開課講座，在文政學部增設四個講座、理農學部四個講座。各學部擴充為24個講座（敕令第32號）。在文政學部，增設國語學?國文學第二、言語學、西洋史學?史學?地理學、民法?民事訴訟法第二講座。在理農學部，增設農學?熱帶農學第三（作物學）、農學?熱帶農學第四（育種學）、農藝化學第三（營養化學）、畜產學等講座。
1931年：頒布學位令，實施學位授與制度化。
1936年1月1日：設置醫學部。醫學部由解剖學第壹、解剖學第二、生理學第壹、生理學第二、生化學、病理學第壹、細菌學等講座所構成。
1936年3月31日：醫學部開課。整合臺北醫學專門學校，在那裏設置附屬醫學專門部。
1937年1月1日：醫學部增設五個講座，***擴充為12個講座。增設病理學第二、寄生蟲學、藥理學、法醫學、內科學等講座。
1937年8月7日：在文政學部增設壹個講座、理農學部增設兩個講座。文政學部擴充為25個講座、理農學部26個講座（敕令第409號）。文政學部增設商法講座，理農學部增設地質學第二（巖石學、礦物學、礦床地質學）、化學第三（無機化學）講座。
1938年1月11日：醫學部增設臨床系8個講座，***擴充為20個講座。增設內科學第二、外科學第壹、外科學第二、產科學?婦人科學、小兒科學、眼科學、皮膚科學?泌尿器科學、耳鼻咽喉科學講座。
1938年4月1日：合並臺灣總督府臺北醫院，在那裏設置醫學部附屬醫院。
1939年1月1日：醫學部增設四個講座，合計***24個講座。增設衛生學、內科學第三、精神病學、齒科學講座。
1939年4月27日 附設熱帶醫學研究所。
1940年3月30日 在理農學部，增設釀造學講座，將農產制造學?制糖化學講座改稱為制糖化學講座。理農學部***擴充為27個講座。
1941年4月4日：設置預科。理農學部增設家畜衛生學講座，***擴充為28個講座。
1943年1月1日：設置工學部。
1943年3月13日：附設南方人文研究所（敕令第124號）?南方資源科學研究所（敕令第125號）。
1943年4月1日：理農學部劃分為理學部與農學部（敕令第298號）。附屬農林專門部獨立為臺中高等農林學校。在理學部，增設植物學第三講座（植物形態學）。在農學部，增設畜產學?熱帶畜產學第二、家畜病理學講座。理學部***有12個講座、農學部***有19個講座。
1943年7月1日：工學部開課。在工學部，設置機械工學第壹（機械設計法、機械學、機械力學）～第二（蒸汽原動機）、電氣工學第壹（電氣理論）、第二（電氣通信）、第三（電氣機械）、應用化學第壹（酸堿工業、鹽類、肥料及瓦斯等）、第二（圭酸、鹽、工業化學（水泥及玻璃））、第三（工業電氣化學）、第四（炭水化學及發酵）、土木工學第壹（混凝土工學）、第二（橋梁）、第三（上水及下水）、材料強弱學、工業物理學、應用數學?力學、工業分析學，***計16個講座。
1944年4月4日：理學部增設壹個講座、農學部增設二個講座。理學部擴充為13個講座、農學部21個講座（敕令第229號）。理學部增設化學第四（天然物有機化學）講座。農學部增設農學?熱帶農學第五（工藝作物學）、家畜內科學講座。
1944年7月1日：工學部增設10個講座，***擴充為26個講座。在工學部，增設機械工學第三（內燃機關）、第四（水力學及水力機械）、第五（機械工作法）、電氣工學第四（電力及應用）～第五（電氣測定法）、應用化學第五（石油及燃料）、土木工學第四（河川及港灣）～第五（鐵道及道路）、金屬材料學、工業地質學講座。工業分析學講座改稱為工業分析化學講座。
1945年4月10日：農學部增設壹個講座、工學部增設五個講座。農學部擴充為22個講座、工學部31個講座。在農學部，增設家畜外科學講座。在工學部，增設機械工學第六（冷凍機冷藏法及冷房化學機械）、電氣工學第六（高周波電氣工學）、應用化學第六（脂肪油、芳香油、合成化學工業）、土木工學第六（構造力學）、建築學講座。