1、微生物菌劑:指工業生產繁殖後的目標微生物(有效菌)，利用多孔物質吸收該菌的發酵液制成活菌制劑。
2.有機肥:指主要來源於植物和/或動物，施入土壤為植物提供營養的含碳物質。
第二，特點不同
1.微生物菌劑:是微生物的載體，不含營養成分。使用後可通過微生物的生理代謝活動，促進土壤中有機肥、化肥和礦質養分的釋放。
2.有機肥:含有大量有益物質，如氮、磷、鉀、有機酸、肽類等。
第三，用法不同
1，微生物菌劑:多用作基肥、種肥和追肥。
2.有機肥:肥料有效期長，多用作基肥。
微生物菌劑與有機肥的區別
第四，角色不同
1，微生物菌劑:能提高作物抵抗力，改善作物品質，抑制土壤中有害細菌的生長，調節土壤的理化性質。
2.有機肥:能增加土壤中有機質的含量，促進微生物繁殖，改善土壤的理化性質和生物活性，為作物提供全面的營養。