目前申請人辦理馬德裏商標註冊有兩種方式：
壹是委托商標代理機構辦理
二是直接向商標局提交馬德裏商標國際註冊申請：
1、網上申請，自2018年6月21日起，馬德裏商標國際註冊網上申請系統正式上線運行，商標代理機構和國內申請人均可註冊登錄“商標網上申請系統”，在“國際註冊申請”欄目中在線提交國際註冊申請；
2、紙件申請，申請人準備好所需的申請材料，可通過郵寄的方式向商標局國際註冊處遞交，或選擇就近到商標局國際處、商標局駐中關村國家自主創新示範區辦事處或北京、上海、廣州、重慶、濟南、鄭州的商標審查協作中心及各省、自治區、直轄市工商行政管理局、市場監督管理局已開展馬德裏商標國際註冊申請受理業務的商標受理窗口遞交。