1）冷靜期：歐盟商標從公告之日起，在先權利人有三個月的時間可以對公示的商標申請提出異議。這是壹個絕對的時間要求，換言之，異議期不能延長，超過這個時間之後，任何異議都不再被受理。對異議人而言，異議的提交分為兩個階段：首先，自公告之日起三個月內，異議人提交異議告知（即僅提交基礎異議申請），並支付相應的異議費用。隨後，壹旦EUIPO收到並受理異議告知，將向相關方發送通知，告知他們接下來是為期兩個月的冷靜期，希望相關方可以在這壹期限內尋求和解，從而結束異議程序。在異議雙方均向EUIPO提交告知的情況下，這個冷靜期還可以延長。如雙方在期限內均提出延期申請，最多可以延22個月（冷靜期***計最長時長24個月）；在此階段，如果協商成功，可以最小化的節約異議成本。
2）對抗期：冷靜期結束之後正式進入對抗期。異議人可在冷靜期結束日第二天起2個月內補充異議理由及證據。被異議人需在異議人提交完異議理由及證據結束日起2個月內進行答辯。（在此階段，如果異議人列出的在先商標有註冊超過五年的，被異議人可以要求異議人提交這些商標的使用證據，被異議人則可以在異議人舉證之後再提交答辯理由和證據）。
3）賠償要求：歐盟商標異議決定涉及到賠償制度。根據異議結果，敗訴方需要賠償給勝訴方壹定金額的官費和律師費用。如果異議僅部分成功，則雙方承擔各自的成本費用。在此，很多當事人並沒有按照約定履行上述賠償制度。雖然不繳納賠償金沒有即時的風險，但企業的發展是壹個長遠的計劃，這種風險可能會在未來的某個時間點發生，欠繳相當於壹個隱患，可能會給未來帶來更大的損失。