靈活使用
組合註冊壹經核準，只能按照註冊時商標的組合方式使用，不能更改，組合方式不能更改，不能單獨使用，否則不能作為註冊商標使用，不能標註註冊商標。使用單獨註冊的商標時，可以任意使用其中的任何部分，同時標註註冊商標，也可以任意組合使用，在各部分標註註冊商標。壹般情況下，拆解後可以單獨註冊的，合並後與他人商標近似的可能性較小。
國璽商標事務所建議以JD.COM為例。文字商標、英文商標、圖形商標分別註冊，可隨意變更，靈活組合。
圖形替換
組合註冊，如果企業想隨著發展需要改變商標的圖形部分，那麽之前註冊的商標用處不大。因為改變圖形就意味著改變商標，需要重新申請商標，所以如果想保留原商標，需要付費；如果不需要保留就需要重新申請新商標，那麽原商標積累的歷史就得為零。而且重新申請可能不會被批準，存在壹定的註冊風險。
單獨註冊，更換圖形時，只需註銷原圖形商標，重新申請圖形商標即可。圖形商標註冊成功後，可以與原有的漢字、字母、數字商標任意組合使用。
侵權判定
在組合註冊中，如果侵權人只使用組合商標的壹部分，法院不壹定能認定侵權人使用的商標與組合商標是近似商標。如果單獨註冊，如果侵權人仍然使用組合商標的壹部分，法院將極有可能認定侵權人使用的商標與單獨註冊的商標近似。