法律分析：公司申請註冊商標流程如下：
1、確定需要註冊商標的商品項目。
2、查詢。在商標註冊之前，進行查詢，是決定商標能不能註冊成功的重要壹步，通常代理機構有專業的查詢軟件進行查詢，也可以進入國家商標局的官方網站來查詢。
3、商標風險評估。
4、制作商標申請資料。若申請人是公司的，要提供公司營業執照副本復印件、商標圖樣等；若申請人是個人，則需提供個人身份證復印件、個體工商戶營業執照等。
5、登錄國家商標局網站，進行註冊之後，就能在網站提交商標申請了。按照提示，填寫商標註冊申請資料，檢查無誤後，直接通過網銀轉賬，還要記得查看申請有沒有被受理，扣款有沒有成功。
法律依據：《中華人民***和國商標法》
第二十二條 商標註冊申請人應當按規定的商品分類表填報使用商標的商品類別和商品名稱，提出註冊申請。商標註冊申請人可以通過壹份申請就多個類別的商品申請註冊同壹商標。商標註冊申請等有關文件，可以以書面方式或者數據電文方式提出。
第二十三條 註冊商標需要在核定使用範圍之外的商品上取得商標專用權的，應當另行提出註冊申請。