核仁的大小、形狀和數量因生物種類、細胞形狀和生理狀態而異。核仁是核糖體RNA(核糖體RNA)合成、加工和組裝的場所，因此核仁的結構和組成與其功能相適應，壹般包括三個基本成分:
位於核仁中央，是壹個淺染區，是rDNA(即被轉錄產生rRNA的DNA，形狀特別像樹，如圖)的儲存位點。註意，它只存儲在這裏，不在這裏轉錄，rDNA在別處轉錄。
(1)光纖中心(簡稱FC)
(2)致密纖維組分(簡稱DFC)
位於核仁表面，染色較深，由致密纖維組成，故稱為致密纖維成分。通常情況下，看不到顆粒。它是核仁中電子密度最高的部分，以環狀或半月形包圍纖維成分。
是rDNA轉錄rRNA並對其進行加工的區域(目前仍有爭議。)
(3)顆粒組分(簡稱GC)
位於核仁周圍，是代謝核仁中的主要結構，顆粒成分中的顆粒實際上是正在加工成熟的核糖體亞前體顆粒。
核仁的電子顯微照片
除上述三種基本成分外，核仁外雖然沒有膜，但被或多或少的染色質所包圍，稱為核仁染色質。
另外，如果用特定的酶處理核仁，在電子顯微鏡下可以觀察到壹些殘留的結構，稱為核仁基質或核仁骨架，FC、DFC、GC三種成分都丟失在這種無定形的基質中。
只有壹個核仁？
不是，核仁的數量壹般是1~2，核仁的數量和大小根據細胞類型或細胞生理功能而有所不同。
壹般來說，蛋白質中合成強或分裂增殖快的細胞，如神經細胞、卵細胞、胰腺腺泡細胞等。，核仁更大，數量更多；
但蛋白質合成功能不活躍的細胞，如精細胞、成熟血細胞、肌細胞等。，有很少甚至沒有核仁。
核仁在細胞分裂前期消失，在後期重新出現。？
參考:趙宗江，細胞生物學？新世紀第3版，中國中醫藥出版社，2016.12，第75頁。