中國自從三聚氰胺事件後，所有的食品都不是免檢產品，很多綠色食品都在認證過程中。此外，中國綠色食品發展中心認證部也表示，需要經過嚴格審查才能獲得綠色食品認證證書。
綠色食品認證體系需要從產地環境、生產過程、包裝標識、產品質量四個方面進行認證，認證證書有效期不長，只有三年。過了有效期，還需要復檢。如果在審查過程中出現任何問題，將取消綠色食品認證。
綠色食品標誌是綠色食品發展中心在國家工商行政管理總局商標局正式註冊的質量認證標誌。它由三部分組成，即上面的太陽、下面的葉子和中間的花蕾，象征著自然生態；顏色為綠色，象征生命、農業和環保；圖形是壹個正圓圈，表示保護。
AA級綠色食品標誌和字體為白底綠色，A級綠色食品標誌和字體為白底綠色。整個人物在明媚的陽光下描繪出壹種和諧的生機，告訴人們綠色食品是來自純凈良好生態環境的安全無汙染的食品，能給人們帶來旺盛的生命力。