提交歐盟商標註冊的申請分為在線申請和紙質申請兩種，目前在線提交歐盟商標註冊申請的費用更低，而且只需使用壹種語言就可以了。另外歐盟商標註冊還可以走快速申請渠道，這樣加快了歐盟商標的審查進程。
第2步：歐盟商標審查
歐盟知識產權局收到申請人提交的歐盟商標註冊申請後會進行商標審查，如果有問題會通知歐盟商標申請人在2個月內進行補正，如果在規定的時間內沒有進行商標補正的，歐盟知識產權局會駁回歐盟商標申請，可以駁回全部或是部分。
第3步：公開歐盟商標申請及商標公告異議
如果歐盟知識產權局在審查申請人的歐盟商標申請時，發現沒有任何問題，申請人的歐盟商標註冊申請會被公開在歐盟商標公報上。任何人可以在申請公開1-3個月內對該商標註冊申請提出商標異議。
第4步：歐盟商標註冊及公開
在1-3個月內的公告異議期沒有人提出商標異議或是意見的，歐盟知識產權局會對申請人提出的歐盟商標註冊申請進行商標註冊，並在歐盟商標公報進行公開該註冊商標，發給申請人電子註冊證書。