商標權人向中國海關申請采取依職權保護措施前，應當按照《知識產權海關保護條例》第七條的規定，將其註冊商標及其他有關情況向海關總署進行備案。商標權海關備案的主要目的是為了有效地打擊進出口的假冒商品及企業。
商標海關備案，是知識產權海關保護備案的壹個俗稱。簡單來說，就是企業或經營戶把自己的商標在海關總署進行備案，之後，每次有相同商標的商品需要通關，都會接到當地海關發來的書面通知，以確認該商品是否由商標持有者銷售。
盡管法律對此不做要求，但這樣做確實很有用。核查結論如果是該商品商標侵權，而侵權標誌可以去除，貨物就會被捐給慈善機構，若侵權標誌不可以去除，貨物就會被全部銷毀。檢查過程中存儲及銷毀貨物的費用將從商標註冊人的保證金中扣除。
那麽，如何辦理商標權海關備案呢？
壹、企業商標海關備案需要提供壹下資料：
1、電子版商標標識（商標註冊證書上的商標標識）
2、三張商品及包裝圖片(反映使用本商標的商品及包裝的整體外貌的圖片，也可以是反映商品及包裝的局部主要特征的圖片)
3、代理委托書（格式文件，由代理機構提供）
二、商標備案辦理時間：兩個月左右。
申請人提交書面申請後，可隨時登錄系統查詢海關總署審核其申請的情況。海關總署會在自收到申請人提交的全部申請文件之日起30-60個工作日內作出是否準予備案的決定，並書面通知申請人。