識別轉基因西紅柿。註意以下總結源自已有部分品種，或者大多數情況，未必涵蓋全部，未必絕對如此。請查看本人提供的資料來源確認。
傳統非轉基因西紅柿：皮薄，成熟後是軟的，紅色，酸中帶甜，易變質腐爛。
轉基因西紅柿：皮厚，果體硬，長期不變質，多種顏色，含紅色，橘紅色，黃色，綠色，紫色等多種，有些沒有西紅柿的味道，沒有酸味。
成熟後綠色（青色？）的西紅柿高度懷疑轉基因品種。參見下方資料[58]。
西紅柿，其原名番茄，傳統非轉基因西紅柿不耐貯藏，尤其是在夏季西紅柿成熟後會迅速變紅變軟、變質腐爛。而轉入基因極大提高儲藏時間的耐儲藏轉基因西紅柿則可以保存幾個月都不壞。已經報道的耐儲藏轉基因西紅柿皮厚果體硬。[111]
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據報道：耐儲藏的轉基因西紅柿保持了它們的質地和堅硬程度長達45天，相比之下傳統番茄在15天之後就開始萎縮並失去了質地。[152]實際可能不到15天就變質，且保存時間與保存的方法和環境有關
另據報道：拿番茄來說，國內種子種出來的可能保存壹兩天就壞了，但國外的種子長出來的能儲藏10天甚至20天。[168]
中國農業大學培育成功的第四代轉基因西紅柿，其特點是成熟後仍為綠色，質地堅硬，采摘後在常溫條件下貯藏保鮮期可達三個月。雖然顏色為綠色，但並不是未成熟，商家在出售前只需用少量乙烯就可將它變紅變軟，如普通西紅柿壹般，而且其糖份、酸份及維生素含量均高於普通西紅柿。[58]
據報道：傳統非轉基因西紅柿皮薄，紅色，味道酸中帶甜。市場上已有轉基因西紅柿皮厚，味道不酸反而發澀，口感普遍不佳，耐儲藏的沒有西紅柿味。[112]