數控車床有三個坐標系，分別稱為機械坐標系、編程坐標系和工件坐標系。
機械坐標系原點是制造機床時廠家固定的坐標系原點，也稱機械零點。也就是絕對坐標。它是在機床裝配和調試過程中確定的，是機床加工的基準。在使用中，機械坐標系由參考點的相對坐標確定。機床系統啟動後，通過返回參考點建立機械坐標系。坐標系壹旦建立，只要不切斷電源，就不會改變。
編程坐標系是編程時使用的坐標系，也可以稱為相對坐標系。壹般我們把Z軸和工件的軸重合，X軸放在工件的端面上。
工件坐標系是機床用於加工的坐標系，應與編程坐標系壹致。編程坐標系與工程坐標系是否壹致是操作的關鍵。工件坐標系的建立是通過系統的程序語句設置刀具當前位置的坐標值來確定的。加工前，應先對準刀具，然後將顯示的坐標清零。對於其他刀具，應將顯示的坐標值寫入相應的刀具補償參數中。然後測量對刀直徑фd，將刀具移動到坐標顯示X=a-dZ=b的位置，就可以運行程序了。加工過程中按復位或急停鍵，回到設定的起點繼續加工。但是如果發生意外，比如X或Z軸沒有伺服，跟蹤誤差，電源故障等。，系統只能重啟，重啟後設定的工件坐標系會消失，需要重新對刀。因此，工件坐標也可以說是壹個相對坐標系。