在日本設立的分公司可以代替總公司提交商標申請嗎？

我不能。根據查詢，小盾知識產權網顯示。分公司不能代替總公司提交商標申請。分公司只能以分公司的名義作為商標申請人申請商標註冊。商標註冊成功後，該商標只屬於分公司名稱。如果總公司需要使用，需要得到分公司的授權，並在商標局辦理備案許可手續。