註冊商標的公告下來了。如果別人在用，我能保護自己的權利嗎？

這個要看情況。如果妳申請時他人已經在使用該註冊商標，當妳取得該註冊商標後，他人可以在原使用範圍內繼續使用。但是如果別人在妳申請後使用了商標，妳可以要求對方停止使用。如果協商不成，可以向法院提起訴訟，以商標侵權為由要求對方停止使用。