公司登記機關是所在轄區的工商行政管理局，而商標的登記機關是國家商標局，這兩個是不同的系統，只要妳的公司沒有註銷，壹般正常情況下是可以進行商標轉讓的。
不過公司被列入經營異常名錄被受讓人知道也有點影響，工商異常的主要原因是未按時年報或者地址異常，解除異常的方法並不復雜：
1、網上查看企業被列入異常的原因後按照不同情況準備資料；
2、按照企業情況填寫移出經驗異常名錄申請表後和相關資料交給檢查部門；
3、檢查部門收到申請表和證明材料之後，將在5個工作日左右的時間就會做出回復，解除工商異常情況。