2.甲下型:整個指甲可呈灰色，逐漸變為黃褐色直至黑色，然後甲板變質，甲床變厚，深甲包括甲床及周圍組織被真菌感染。由於外用藥的滲透性有限，很難治療指甲深部組織和指甲周圍組織。此時單純外用藥無法達到治療效果，需要考慮聯合使用口服藥物進行治療。臨床上通常選擇口服藥物如特比萘芬和伊曲康唑進行抗真菌治療。
除了藥物治療外，如果癥狀嚴重或並發甲溝炎，就要遵醫囑摘除病甲，也可采用激光治療和光動力治療，抑制致病菌，殺滅微生物。