老板新註冊壹個公司，屬於餐飲行業，現有3家店加盟使用我們公司商標，這三家店以個體戶註冊，定額納稅，

妳們公司收取的加盟費要繳納營業稅及城建稅、教育費附加等附加稅費。在三個店裏的投資，如果是公司的，分得的投資收益要納入當年損益繳納企業所得稅。