農副產品深加工要註冊商標，先要向商標註冊機構提供從事農副產品深加工的營業執照副本復印件、從事農副產品深加工經營者的身份證復印件、申請註冊商標的圖案和文字，然後由商標註冊機構進行初審，初審通過，商標註冊機構會出具註冊商標受理通知書，再進行公告，公告期內無異議提出，則商標註冊機構就會辦理農副產品深加工的註冊商標。