第二個指標是細菌數量。這個指標其實很重要，因為關系到實際效果。細菌量越大，相對越好。當然還是有上限的。細菌超過6543.8+000億個，外來細菌太多可能傳入，壹下子占領本地也可能造成不好的影響。
第三個指標是保護。保護層越多越好，也越容易穿透胃酸的腐蝕。有些細菌不怕胃酸，比如嗜酸乳桿菌，可以通過胃酸存活。但大多數益生菌在空腹胃酸狀態下無法存活，需要良好的保護層才能存活。