1.JD.COM采取自營購銷的模式，即JD.COM負責從相應的品牌服務商處進貨，將貨物入庫到JD.COM倉庫，JD.COM負責整個店鋪的配送、售後、進銷存。旗艦店是品牌商家借助JD.COM平臺銷售自己的產品，就像商場裏的小店面。
2.JD.COM自己用自己的京東物流，發貨快，發貨速度快。旗艦店是品牌發貨，商品要先從品牌倉庫調出來，發貨、運輸、配送需要很長時間。