淘寶旗艦店是指商家以自己的品牌(或TM)入駐淘寶商城，所開的店鋪稱為“某品牌旗艦店”。這種商城店就是淘寶旗艦店。所以壹般不會有假貨，因為這些品牌只是以淘寶為平臺，商品都是各大品牌直接銷售的。
旗艦店壹詞來源於歐美大城市的品牌中心店名稱。其實就是城市中心店或者區域中心店。壹般是某個商家或品牌在繁華地段最大、最全、最豪華的店，通常只經營某個品牌的系列產品或產品。