截止2019年，伊犁哈薩克自治州***轄11個縣級行政區，包括3個縣級市、7個縣、1個自治縣，分別是伊寧市、奎屯市、霍爾果斯市、伊寧縣、霍城縣、鞏留縣、新源縣、昭蘇縣、特克斯縣、尼勒克縣、察布查爾錫伯自治縣。
1、伊寧市
伊寧市（維語：?, 拉丁維文：Ghulja）位於祖國新疆西北邊陲，地處伊犁河谷盆地中央。地理坐標為北緯43°50′～44°09′、東經80°04′～81°29′之間。東連伊寧縣，西鄰霍城縣，南瀕伊犁河與察布查爾錫伯自治縣隔河相望，北依科古爾琴山。
2、奎屯市
奎屯，成立於1975年，是新疆維吾爾自治區伊犁哈薩克自治州直屬縣級市。位於天山北麓中段，準噶爾盆地西南部，東與塔城地區沙灣縣接壤，西與塔城地區烏蘇市毗鄰，北與克拉瑪依市克拉瑪依區相接，南與克拉瑪依市獨山子區相連。
3、霍爾果斯市
霍爾果斯，隸屬於新疆維吾爾自治區伊犁哈薩克自治州，地處中國西部邊陲，與哈薩克斯坦接壤，西承中亞五國，東接內陸省市，是312國道、連霍高速公路的終點。
距伊犁州州府伊寧市90公裏，距新疆維吾爾自治區首府烏魯木齊市670公裏，距中亞中心城市、哈薩克斯坦原首都阿拉木圖378公裏，對外覆蓋半徑1000公裏以內的區域是中亞地區人口稠密區、經濟發達區和市場中心。
4、新源縣
新源縣位於新疆維吾爾自治區西北部，天山北麓，伊犁河谷東端，鞏乃斯河河谷地帶。東起艾肯達阪，南與鞏留縣、和靜縣為鄰，東北與尼勒克縣、沙灣縣、和靜縣為界。
5、特克斯縣
特克斯縣，新疆維吾爾自治區伊犁哈薩克自治州下轄縣，地處伊犁河上遊的特克斯河谷地東段。縣城距伊寧市116千米，距烏魯木齊815千米。東、北與鞏留縣相鄰、東與和靜縣為鄰，西和昭蘇縣接壤，南同拜城縣毗連，北與察布查爾縣交界。
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