當面對嬰兒益生菌的選擇時，首先要看的是益生菌選擇的菌種。益生菌的種類很多，不同菌種的適宜種群和作用也不壹樣。截至目前，國家衛健委已批準10株益生菌可用於嬰幼兒食品，其中嗜酸乳桿菌僅用於1歲以上嬰幼兒食品。常見的菌株有很多，這裏列舉幾個，相信家長們會印象深刻。如瑞士乳桿菌R0052、嬰兒雙歧桿菌R0033、動物雙歧桿菌BB-12，能促進吸收、調節、維持菌群平衡；減少過敏和敏感的短雙歧桿菌M-16V；刺激體內保護的兩歧雙歧桿菌R0071等。家長在為嬰兒購買益生菌時，可以根據孩子的體質來鑒別這些菌株。
其次，益生菌的有效性也是家長需要註意的要點。使益生菌發揮有效作用的關鍵在於活菌數和益生菌的活性。我國衛計委發布的《益生菌保健食品申報與評價規範》規定了活性益生菌的含量標準:活性益生菌保健食品在其保質期內活菌數不得低於106CFU/ml(g)。益生菌是有生命周期的活性物質，對溫度、濕度、pH值等有嚴格的要求。生產過程中和出廠後的儲運條件都會對它們的活動產生壹定的影響。除了上述外界因素，益生菌的劑型和加工工藝是影響益生菌活性的關鍵因素。家長在購買嬰幼兒益生菌時，應註意外包裝上的相關標簽。
最後，嬰幼兒益生菌要有相關認證，多菌種協同的臨床認證是否有相應的作用或者品類的相關認證都是值得參考的。嬰幼兒益生菌分為食品級(食品QS藍標或食品生產許可證SC號)、保健品級(警察機動部隊，健字號)和抗生素級(藥品準字號)。其中，食品級和保健品可用於調節腸道健康，維持免疫系統平衡。但抗生素級益生菌不能長期食用，要在醫生指導下服用。市場上常見的合生元益生菌都是食品級益生菌，每袋含有數十億個活菌，原生菌的組合配方友好有效，已獲得多國認證。家長可以參考這類品牌。
另外，筆者提醒大家，現在市面上的益生菌產品很多，有粉劑、滴劑、原味、奶味等...不勝枚舉。它的存放方式和餵養方式都不壹樣，也適合不同年齡的孩子。在學會了如何選擇和定義嬰兒食品級益生菌的品牌後，也要根據孩子的實際情況，選擇更適合的品牌。