國家工商行政管理總局行政編制300名(含兩委15離退休幹部)。其中，主任1人，副主任4人，廳局級主任42人(含黨委專職副書記1人，離退休幹部辦公室領導1人)。
內部機制
國家工商行政管理總局13內設機構(正廳級):
(1)綜合辦公室
負責文電、信息、統計、保密、安全、信訪等工作。；承辦財務、資產管理、政務公開、新聞發布等工作。
(二)法規司
組織起草相關法律法規草案和規章；組織工商行政執法監督聽證，承辦或參與相關行政復議、行政訴訟和賠償工作；
承擔本系統的行政執法監督工作。
(3)反壟斷和反不正當競爭執法局
制定反壟斷和反不正當競爭的具體措施和辦法；
承擔相關反壟斷執法工作；查處市場不正當競爭、商業賄賂、走私等經濟違法行為，督辦大案要案和典型案件。
(4)直銷監督管理局
制定直銷監督管理和禁止傳銷的具體措施和辦法；
承擔對直銷企業和直銷員及其直銷活動的監督管理；
查處違法直銷和傳銷的重大案件；
承諾協調有關方面開展打擊傳銷的聯合行動。
(5)消費者保護局
制定保護消費者權益的具體措施和辦法；
承擔流通領域商品質量的監督管理；在相關服務領域開展消費維權工作；查處假冒等違法行為；承擔引導消費者咨詢、申訴、舉報受理、處理和網絡系統建設。
(六)市場監管管理部門
制定規範市場秩序的具體措施和辦法；
承擔規範和維護各類市場經營秩序的工作；承擔網絡商品交易及相關服務的監督管理；組織實施合同行政監督管理；
承辦動產抵押物的登記、經紀和拍賣管理；查處合同詐騙等違法行為；
組織和指導商品交易市場的信用分類管理；組織和指導市場的專項治理。
(七)食品流通監督管理部門
制定流通領域食品安全監督管理的具體措施和辦法；
組織實施流通領域食品安全監督檢查、質量監測和相關市場準入制度；
承擔流通領域重大食品安全突發事件的處理和重大食品安全案件的調查處理。
(8)企業註冊局
制定企業登記管理的具體辦法和措施；
組織和指導企業登記管理工作；
承擔規定範圍內的企業登記，並對其登記行為進行監督檢查；
組織和指導企業信用分類管理；
承擔全國企業登記管理信息數據庫的建立和維護以及境內企業登記信息的分析和公開。
(9)外商投資企業登記局
制定外商投資企業登記管理的具體辦法和措施；
承辦外商投資企業和外國(地區)企業常駐代表機構的登記，並對其登記進行監督檢查；
承擔外商投資企業登記信息的分析和披露工作。
(10)廣告監督管理部門
擬訂廣告業發展規劃、政策和措施並組織實施；制定廣告監督管理的具體措施和辦法；組織、指導、監督和管理廣告活動；組織並監控各種媒體的廣告發布；查處虛假廣告等違法行為；指導廣告審查機構和廣告行業組織的工作。
(十壹)個體私營經濟監督管理部門
調查研究個體私營經濟的發展和管理，制定監督管理的具體措施和辦法；指導個體工商戶、私營企業和農民專業合作社的登記註冊和監督管理；
組織和指導個體工商戶的信用分類管理；查處取締無照經營；
指導個體勞動者協會和私營企業協會的工作。
(12)人事部
負責機關及直屬單位的人事管理、機構設置和隊伍建設；
承辦省、自治區、直轄市工商行政管理機關領導班子雙重管理的有關事項；
指導本系統隊伍建設的相關工作。
(十三)國際合作司(港澳臺辦公室)
開展工商行政管理國際合作與交流，承辦涉港澳臺合作與交流；承辦機關和直屬單位的外事工作。
黨委
負責北京市機關和直屬單位黨群工作。
離退休幹部辦公室負責機關離退休幹部工作，指導直屬單位離退休幹部工作。
紀檢組監察局
國家工商行政管理總局商標局
承擔商標註冊和管理等行政職能。
國家工商行政管理總局商標評審委員會
承擔處理商標糾紛等行政職能。
公共機構
器官服務中心
經濟信息中心
中國工商報社
中國工商出版社
中國消費者報社
中國工商管理學會
行政學院
市場經濟監督管理研究中心
中國私營企業協會
中國消費者協會
中國廣告協會
中國商標協會
通達商標服務中心
省工商行政管理局
北京工商行政管理局
上海工商行政管理局
天津市工商行政管理局
重慶工商行政管理局
河北省工商行政管理局
山西省工商行政管理局
內蒙古自治區工商行政管理局
遼寧省工商行政管理局
吉林省工商行政管理局
黑龍江工商行政管理局
山東省工商行政管理局
江蘇省工商行政管理局
安徽工商行政管理局
浙江省工商行政管理局
江西省工商行政管理局
福建省工商行政管理局
河南省工商行政管理局
湖北省工商行政管理局
湖南省工商行政管理局
廣東省工商行政管理局
廣西壯族自治區工商行政管理局
海南省工商行政管理局
四川省工商行政管理局
雲南省工商行政管理局
貴州省工商行政管理局
西藏自治區工商行政管理局
陜西省工商行政管理局
甘肅省工商行政管理局
寧夏回族自治區工商局
青海省工商行政管理局
新疆維吾爾自治區工商行政管理局
計劃單列市工商行政管理局
青島市工商行政管理局
廈門市工商行政管理局
深圳市市場監督管理局
大連市工商行政管理局
寧波市工商行政管理局
長春市工商行政管理局
武漢市工商行政管理局
杭州市工商行政管理局
哈爾濱工商行政管理局
南京工商行政管理局
西安工商行政管理局
沈陽工商行政管理局
廣州工商行政管理局
濟南市工商局
成都市工商行政管理局