聯席會議辦公室是重大科技成果產業化項目審批聯席會議的日常辦事機構，承擔聯席會議的日常工作，負責具體推進重大科技成果轉化和產業項目統籌工作。
科技金融工作組負責協調金融機構開展符合科技企業特點的制度創新、產品創新、服務創新，吸引聚集金融服務資源等工作。
人才工作組主要負責搭建吸引和聚集高端領軍人才創新創業的服務平臺，吸引國際壹流人才團隊和科研機構，推動建立有利於創新工作的學術環境和與國際接軌的創新創業服務體系。
新技術產品政府采購和應用推廣工作組負責推動實施新技術、新產品政府采購和重大應用示範工程，促進新技術、新產品的應用和推廣。
政策先行先試工作組負責研究制定中關村國家自主創新示範區內有關單位股權激勵試點方案審批實施細則，加快推進股權激勵、高新技術企業認定、科研經費改革、稅收政策、工商管理改革、社會組織改革、知識產權與標準、商標品牌試點等工作。
規劃建設工作組按照土地集約利用原則，負責推進實施中關村國家自主創新示範區空間布局規劃，協調推進重大科技成果產業化項目的選址、規劃建設等方面審批工作，促進重大項目落地實施。
中關村科學城工作組負責推進中關村科學城建設，推動特色產業園區建設，促進重大科技成果產業化項目落地，支持產業技術研究院建設。
凡是國家科技重大專項、重大科技基礎設施、重大科技成果產業化項目，圍繞項目確定、資金支持、選址和產業布局等重大問題，都通過重大科技成果產業化項目審批聯席會議由專家組成員評定。圍繞重大科技成果產業化和產業基建項目、科技金融扶持、高端人才引進、股權激勵試點方案、高新技術企業認定等審批，由各工作組聯合推進，並行審批，***同研究決策。各工作組通過聯席會議為申報企業提供優惠政策支持的“壹條龍”服務。
中關村創新平臺受理大廳已正式啟用，設立6大類受理窗口，包括重大科技成果產業化項目審批、科技金融、人才、新技術新產品政府采購和應用推廣、政策先行先試和規劃建設等。其中高新技術企業認定受理窗口主要受理示範區內高新技術企業的申報材料，並接受高新技術企業認定相關工作的咨詢，進壹步加強高新技術企業認定指導和政策宣傳工作。在受理方面設兩類窗口：壹類是負責受理各區縣、園區管委會統壹收集申報企業材料窗口；另壹類是負責受理海澱園內註冊企業的高新技術企業認定申報材料窗口。