知識產權行政保護是指依法處理知識產權糾紛、查處知識產權違法行為等壹系列行政執法活動。
鑒於程序復雜、取證困難、周期長、執行效率低以及訴訟文化的影響，在實踐中，當事人通常會選擇回避司法途徑解決知識產權糾紛，普遍傾向於選擇快捷的行政執法打擊侵權人，這也符合我國官本位或公權力本位思維的國情，有利於提高我國的執法效率。
1.知識產權行政保護的實施範圍
我國行政保護的範圍包括以下三個方面:
(1)開展知識產權專項執法活動，保護知識產權權利人合法權益。在我國知識產權行政執法體系中，專項執法活動獨樹壹幟，可以集中執法資源，針對壹定時期、壹定區域開展大規模、高效率的執法行動。
(二)受理和查處知識產權侵權案件，維護市場公平競爭秩序。版權管理機關處理盜版出版物和音像制品案件，專利管理機關受理專利侵權和其他專利糾紛案件，工商行政管理機關查處商標違法行為。
(3)建立知識產權海關保護機制，查處進出口產品知識產權侵權行為。
其他國家也有知識產權行政執法，主要體現在知識產權海關保護上。這些國家知識產權行政部門的主要職責是防止其他國家侵犯其知識產權或防止侵權產品進入本國。
2.知識產權行政保護執法部門
我國知識產權行政執法權分屬不同的行政機關，行政執法部門可分為三類:壹是確權部門，如國家知識產權局、工商總局商標局、國家版權局、商務部、文化部、農業部、國家林業局、質檢總局、科技部、國防專利局；二是審判部門，如專利復審委員會、商標評審委員會等。三是行政部門，如國家保護知識產權工作小組辦公室、海關總署、公安部、地方相關行政部門等。主要行政執法部門及職責如下:
國家知識產權局負責集成電路專利權和布圖設計權，國家工商總局商標局負責商標權，國家版權局負責版權，國家工商總局公平貿易局負責制止不正當競爭，國家質檢總局負責地理標誌， 農業部負責農業植物新品種，國家林業局負責林業植物新品種，商務部負責國際貿易中的知識產權，科技部負責科技相關知識產權，海關總署負責進出境貨物相關知識產權。
2006年，商務部設立了50個知識產權保護舉報投訴服務中心，以加強對分散在各個機構的知識產權行政保護職能的協調。該中心面向全社會受理侵犯商標權、專利權、著作權等知識產權的舉報和投訴，對收到的舉報和投訴進行初步審查，將符合受理條件的舉報和投訴轉交相應的行政執法機關和公安、司法機關依法處理，避免權利人盲目選擇執法機關投訴的問題，提高知識產權行政保護的效率。
3.知識產權行政保護的實施
對於侵犯知識產權的行為，權利人可以向行政機關申訴，行政機關可以依據職權進行查處。我國專利法第四次修訂草案的核心內容之壹是加強對專利的行政保護，努力發揮行政手段的優勢，快速有效地維護權利人的利益，制止侵犯專利權的行為，促進行政保護與司法保護的協調。所以專利糾紛可以先通過行政手段解決，如果解決不了或者對結果不滿意，可以通過司法手段解決。行政裁決不能是終局的，司法判決才是終局的。
為進壹步加強知識產權行政保護，2013年，國家建立副總理級知識產權保護協調機制，為國內企業和在華外資企業提供更加安全的營商環境；2014年初，北京、天津、河北、山西、內蒙古* * *知識產權局簽訂工作協議，成立華北地區專利行政執法協作調度中心。