最終，弗裏曼無法忍受太空中原子的緩慢速度，轉而研究壹些更私人的問題。與此同時，弗裏曼在麻省理工學院的導師艾薩克·克萊納在黑梅薩研究設施的絕密計劃上取得了很大進展，他迫切需要壹些助手來完成剩下的工作。弗裏曼無疑被選中了。他同意在布萊克梅薩研究機構工作，因為他希望他在那裏的工作能夠解釋他在天體物理學和量子物理學方面的各種問題和疑慮。
遊戲開始時，弗裏曼正在新墨西哥州某處的研究所裏研究那些機密問題。他被分配到研究所最深處的異常材料部，從事壹些原子核和亞原子的研究。有趣的是，雖然弗裏曼獲得了麻省理工的博士學位，但他並沒有在遊戲中使用這些理論中的任何壹個。巴尼·卡爾霍恩在《半條命2》的開頭就對這件事開過玩笑，當時弗裏曼正在做壹些類似於“技術性質”的工作。
弗裏曼戴著壹副黑框眼鏡，留著壹撮山羊胡。他非常擅長運動。雖然看起來弗裏曼是個玩槍專家，但他在黑山事件前從未用過槍(除了他6歲時自制的壹門能打網球的大炮)。弗裏曼和遊戲中其他英雄最大的不同就是他是壹名科學家。其他英雄，或者是像毀滅公爵中的Nukem公爵這樣的傳統英雄形象，或者是其他遊戲中的戰士形象。遊戲裏的主角也開玩笑說:“反正...煩人的遊戲主角壹般都用撬棍。”
戈登·弗裏曼名字的由來:理查德·費曼，1915月08日，11—1988年2月，15，美國著名物理學家。
1995進入麻省理工學院(MIT)，先學數學，後學物理。1999畢業，畢業論文發表在Physis。Rev .，裏面有壹個以他的名字命名的量子力學公式。戈登·弗裏曼在1壹代被設定為27歲的麻省理工學院研究生，而在半條命2中，為了紀念理查德·費曼創造引力槍2001，弗裏曼和他的團隊在16年3月正在進行的實驗出現了壹個可怕的錯誤(可能是有人故意造成的)。結果時空連續體被打破，外星人進入研究所，殺死了他們發現的所有人類。弗裏曼發現自己陷入了腹背受敵的境地:兇殘的外星人和受命清理(殺死所有外星人和類人生物)的政府軍讓他進退兩難。為了生存，這個沒有經過任何專業訓練的理論物理學家決定將人類從混亂中拯救出來。他的英勇行為感動了壹些幸存的科學家，結果他們壹起成為軍方的主要目標。
在經歷了壹系列的冒險，殺死了無數的外星人和士兵後，弗裏曼終於從實驗室瞬移到了外星人的家鄉:Xen，他決定先消滅外星人首領Nihilanth。從最後壹次遭遇中恢復意識後，弗裏曼發現自己面對的是壹個神秘人物——G-Man。這個神秘的科學家從頭到尾都在觀察弗裏曼的壹舉壹動，或者說他壹直在操縱弗裏曼的命運。G-Man用他的能力讓Freeman在地球和Xen之間傳送了好幾次。擺在弗裏曼面前的有兩條路:同意為G-Man和他的“神秘雇員”工作，或者手無寸鐵地死在那些兇殘的外星人手裏。半條命2解釋說弗裏曼接受了G-Man提供給他的工作。
遊戲中屏幕上顯示的信息可以讓玩家知道遊戲的進展和下壹步的行動。通關後，粉絲猜測是神秘的G-Man導演了這場事故，因為有人看到他在實驗前和壹些科學家竊竊私語，事故被描述為“某天早上的壹次傳輸”。雖然遊戲中並沒有明確指出這壹點，但是遊戲的最終結局是尼希蘭斯巢穴中的水晶被同樣的意外摧毀。《半條命2》開始的時候，G-Man在和Gordon說話。當時場景有些迷幻，G-Man的臉在屏幕上來回閃爍，和他在半條命1裏的出場場景很像。G-Man用他特有的神秘語氣告訴Freeman“醒醒吧，聞聞灰燼”。弗裏曼醒來，和兩名公民壹起被“轉移”到17城市。他立刻意識到地球已經被傳送的多維空間帝國控制了。後來，他遇到了巴尼·卡爾霍恩(barney calhoun)和艾麗克斯·萬斯(alyx vance)，他們三個和艾麗克斯的機器人阿狗(A Gou)壹起對抗聯合軍。
在《半條命2》中，弗裏曼為了將人類從控制中解放出來，與聯合軍作戰。黑山事件讓弗裏曼名聲大噪，拯救人類讓他的經歷更加傳奇。人們開始視他為救世主，稱他為“那個自由人”。在殺死數百名盟軍士兵後，弗裏曼不得不面對17城市的所有士兵。他終於找到了聯合部隊的大本營，用反物質反應堆清除了它，消滅了地球上聯合部隊的管理者華萊士·布林——黑山基地的管理者。雖然他和alyx vance壹起被困在爆炸中，但G-Man及時出現讓時間停止，並告訴他，他對自己的表現印象非常深刻。他最後告訴弗裏曼，不會再給他多做選擇題，而是要拿走弗裏曼的自由，囚禁弗裏曼，直到他再次需要。至此，半條命2的結局和前作壹樣，在告訴玩家壹些答案的同時，也帶來了更多的疑問。
半條命2第壹章
第壹章開頭，然後是上半部分的故事，壹群紫色的威爾第人攔住了讓時間停止的G-man，把它推進了壹扇門，把戈登和亞歷克斯·萬斯從爆炸中救了出來。戈登想和亞歷克斯壹起逃離即將到來的大爆炸。當戈登醒來時，他看到壹只狗把自己從廢墟中拉出來。稍後，Alex用剩下的電腦聯系了他的父親Eli。當他得知城堡即將爆炸，將會摧毀整個17的城市。緩解的辦法就是進入城堡，幹擾核心。於是戈登和亞歷克斯上了壹輛舊車，被壹只狗扔進了城堡，壹路解決。之後，我回頭了。踏上了逃離17城的冒險之旅，壹路砍瓜切菜，期間加入了巴尼和部分叛軍，掩護平民撤退。平民最後進入火車站，掩護獲救平民登上火車離開。當戈登和亞歷克斯最終擊毀壹架三角機甲，成功登上從17城市出發的列車時，盟軍城堡發生了巨大的爆炸，爆炸的沖擊波席卷了兩人乘坐的列車。。。至此，第壹章結束，揭開hl2結尾的懸念，帶給玩家另壹個懸念。
半條命2第二章
第二章再次揭示了第壹章的結局。爆炸的沖擊波導致火車被吹倒。戈登和亞歷克斯逃走了。繼續前進，我用電腦聯系了亞歷克斯在木屋裏的父親，被告知被摧毀的城堡已經開始形成壹個巨大的傳送門。壹旦傳送門形成，聯合軍將再次進入地球，全人類將被毀滅！唯壹能阻止它的方法就是發射火箭來阻止傳送門的形成，我們必須把亞歷克斯在城堡裏復制的信息帶回來。只有把數據裏傳送門的代碼輸入到火箭裏，傳送門才能被抵消，於是兩人又出發了。在途中，亞歷克斯被壹個新的怪物攻擊，壹個聯合軍的獵人，受了重傷。戈登也遇到了麻煩。他在關鍵時刻被壹名香港居民在弗雷迪救出，但亞歷克斯的重傷不得不立即接受治療。於是弗雷迪幫的人召集了他們的同伴，把亞歷克斯帶到壹個地下礦井裏的叛軍據點接受治療，這需要獅蟻。於是福地剛和戈登的壹個人深入地下洞穴，壹路拿到了提取物，救了亞歷克斯。在救援過程中，G-man再次出現，並與戈登交談，說，'他們'以前並不關心亞歷克斯，但GMAN堅持要把亞歷克斯帶進來，他的投資必須得到回報。他認為亞歷克斯比他想象的更有價值。讓戈登護送阿歷克斯安全到達白森林。他已經同意遵守壹項協議，讓亞歷克斯告訴伊萊，他已經“準備好迎接意想不到的結果”；之後又消失了。這時，阿歷克斯恢復過來，帶著壹個人從福地崗出發，在路上看到了開往白森林的聯合軍裝甲核心部隊。為了加快速度，戈登和妻子在福迪剛的幫助下找到了壹輛改裝車。告別福地港，開車去白森林。在路上，我試圖通過壹個無線電臺聯系白森林，但我受到了幹擾，不得不繼續前行。途中，在壹所房子裏發現了壹個新的怪物，壹個聯合軍特工。當戈登即將被特工殺死時，特工的生命維持裝置爆炸，特工逃脫。兩人再次遭到盟軍攻擊，在擊敗盟軍後繼續前進。在此期間，我遇到了叛軍和伏擊，最後到達白森林。在火箭基地，亞歷克斯把信息交給了壹個新人:馬格森博士。在此期間，進攻的盟軍被擊退，他們遇到了伊萊和克萊納，並聯系了朱迪思博士，發現他已經乘坐光圈科學的壹艘研究船“北極光”去了北極。但就在接觸的時候，朱迪思遭到了聯軍的襲擊。聯系中斷了。後來Alex把G-man說的話告訴了Eli，Eli極為憤怒。突然，盟軍進攻了。為了保護火箭。戈登和大批叛軍擋住了十幾架三角洲機甲，最後火箭發射了，抵消了傳送門。最後，伊萊在派亞歷克斯和戈登上直升機去追捕朱迪思醫生時，被聯合特工襲擊身亡。戈登和亞歷克斯差點喪命，幸好機器狗及時出現，最後亞歷克斯抱著父親的屍體傷心欲絕。。。至此，第二章結束了，又留下了新的懸念，戈登·弗裏曼又經歷了壹次和以前壹樣驚心動魄的冒險。解決了壹場威脅人類的巨大危機。但是故事還沒有結束，神秘的光圈科學考察船，還有朱迪思博士離開的原因。以及如何徹底打敗聯軍。戈登·弗裏曼的傳奇將會繼續！