該館藏品中的文物、史料大部分是南通本地的，比較珍貴的有海安青墩出土的陶紡輪、張謇1894年中狀元的捷報、大生紡織廠早期的股票、賬本、商標及產品等。當代紡織品的標本是全國各廠獲得金、 銀質獎的產品。基本陳列有“中國紡織擷英”、“南通紡織史”、 “當代優秀紡織品標本”等。
館內的基本陳列展現中國與南通紡織的悠久歷史，還有過去手工紡織染生產的演示、參與項目。花木掩映的琵琶湖，復建的農舍、路亭、城門、古街、牌坊、鐘樓是該館的主要景觀。展品除歷代紡織機具、產品、文獻外，還有19世紀末引進的系列紡織機械。到此漫遊，可增進對紡織歷史發展的認識，並得到回歸自然的美好享受。 南通紡織博物館藏有著名的藍印花布。簡單、原始的藍白兩色，創造出壹個淳樸自然、千變萬化、絢麗多姿的藍白藝術世界。藍印花布的紋樣圖案都來自於民間，反映了百姓的喜聞樂見，寄托著她們對美滿生活的向往和樸素的審美情趣，在題材和內容上，老百姓那種健康和質樸的心靈，在民間藍印花布上得到了形式和內容的完美統壹，因而藍印花布確實真實地反映了壹種深厚的文化和藝術積澱。
南通藍印花布便是其中最具代表性的民間工藝品之壹。由吳元新負責申報的南通藍印花布印染技藝已列入首批國家級非物質文化遺產名錄.南通也被命名為藍印花布之鄉,這些榮譽稱號，與吳元新30多年來默默的在藍印花布領域不斷研究,堅持將傳統傳承了下來是分不開的。
南通民間藍印花布始於明代，流傳至今。經過壹代代民間藝人尤其是當代民間工藝家的不懈努力，從單壹的土布制品走向多種面料的制品，從生活實用型走向實用、裝飾多種類型、從田野阡陌走向城市都會，達到了它前所未有的輝煌。 走進通州城墻，便是通州城壹條街，這裏有仿建的十家店鋪與作坊，錢莊、染莊、布莊、紗莊、收棉莊等百年老店應有盡有，生動詳實的再現了南通近代“花紗布壹條街”的歷史風貌。
這條古街處處蕩漾古韻古風，建築保留了南通地方傳統特色和風格，在這條古色古香的紡織古街上徜徉，仿佛走進了古老而文明的南通歷史，走出古街，映入眼簾的卻是壹派欣欣向榮、日新月異的南通港口美麗的景象。