投資區擬引進產業包括：新興產業主要選定光電產業、新材料產業及現代裝備制造業三大類；輕工產業；高端生產性服務業包括文化創意產業、企業研發服務業、臺資企業營運中心、涉臺金融服務業；現代物流業（保稅區或保稅港區）。將構築龍頭企業帶動、配套企業跟進的產業體系，重點培育綠色智能交通、風電裝備制造、光電信息、上市企業創業園、現代高端服務等五大百億集群和綜合物流樞紐中心、兩岸區域性金融中心，規劃形成以向海產業發展帶和臨海產業發展帶為核心的T型產業空間布局。
規劃建設中的泉州臺商投資區產業規劃分為三大片區：
● 先進制造業片區
準入產業包括新興產業和輕工產業。具體布局新材料產業園、光電產業園、現代裝備制造產業園，以及輕工產業提升園。其中新材料產業園發展以納米材料系列、超導材料為主的電子信息材料、新能源材料、先進陶瓷材料、生態環境材料、新型功能材料、生物醫用材料、新型建築及化工新材料等；光電產業園以發展LED、光伏產業和數字微芯片等為主，現代裝備制造產業園以發展船用設備、發電設備和軌道機車等為主，輕工產業提升園主要是促進區域內現有的鞋業鞋材、紡織服裝和工藝品等產業的技術改造和產業升級。
● 現代服務業片區
準入產業為高端生產性服務業。圍繞百崎湖周邊、洛陽江沿岸和泉州灣海岸，突出其山、海、湖的自然優勢，發展宜居、宜商的濱水區，具體布局文化產業區、臺資企業營運中心、涉臺金融服務中心和高端研發和文教產業區。其中文化產業區以發展工業設計、會展、時尚設計、廣告、創意設計、動漫制作、網絡遊戲、茶文化產業、陶瓷文化創意產業、閩南美食文化產業等為主；臺資企業營運中心以制造業營運中心、商貿物流業營運中心和信息咨詢服務業為主；涉臺金融服務中心以建設對臺離岸金融市場以及對臺金融後臺服務基地、金融改革創新實驗基地和新興金融業態聚集基地為主；高端研發和文教產業區以各行業研發中心、質量檢測中心、信息***享平臺、培訓機構、試驗基地等為主。
● 現代物流業片區
準入產業為現代物流產業。依靠12個十萬噸級的秀塗港，規劃建設15平方公裏的保稅港區，主要開展集裝箱港口運輸裝卸、貨物國際中轉、配送、采購、轉口貿易和出口加工業務及與國際航運配套的金融、保險、代理、理賠、檢測等服務業務。