註冊日本商標的辦理流程：
1、商標註冊申請遞交到日本特許廳；
2、形式審查階段，審查文件是否齊備，內容是否完整；
3、實質審查階段,通過之後加納日本商標註冊官費，予以公告期；
4、日本商標註冊接受系列商標、防禦商標、證明商標、集體商標、商品商標、服務商標、顏色組合商標，聲音商標、氣味商標和立體商標的註冊申請；
5、日本商標註冊遵循《商標註冊用商品和服務國際分類尼斯協定》采用11個服務類類別和34個產品分類類別；
6、有效期： 從註冊日起算10 年有效期，註冊有效期滿前6個月需要申請日本商標續展註冊，6個月的寬展期內，繳納相關費用。
按申請名義提供的材料：
1、以法人名義申請需提供《營業執照》或有效登記證明復印件加蓋公章1 份；
2、以自然人名義申請附個人身份證明文件1份；
3、無論何種名義都需要提供的日本商標註冊材料：
（1）商品名稱和類別(壹份申請費包含10個小產品，超出200RMB壹個)；
（2）提供申請人的詳細信息(中英文；
（3）清晰的JPG檔電子版商標標樣，規格大小200KB以內，像素在“400x400--1500x1500”之間；
（4）辦理註冊日本商標有兩種註冊方式，壹種是直接向日本特許廳提出申請，另壹種則是委托知識產權機構進行辦理；
（5）優先權聲明(視情況而定)。
擴展資料
1、 申請條件?
可以以自然人或法人申請，自然人必須附上護照或身份證復印件，法人必須附上營業執照復印件。
2、?商標申請所需材料
（1）提交申請人的姓名、地址、國籍；
（2）提供商標的中文或外文名稱；
（3）提供20份清晰商標圖樣（2*2/8*8）；
（4）如果商標為彩色，必須指定哪種顏色；如果提交的商標為黑白，以後使用什麽顏色都可以；
（5）所申請的商品或服務類別，假如知道的話；
（6）填寫申請表1份，申請表必須由申請人簽署或由代理人簽署。
3、商標查詢
由於商標的申請是壹個復雜而漫長的過程，為了避免在申請的過程中出現徒勞無功並浪費金錢的現象，查詢是壹個必不可少的環節。查詢通常可以得到兩個結果，壹是得知所申請的商標是否與他人的重復或類似；二是得知我們的商標是否符合政府關於商標法律的標準。
法律並沒有規定壹定要通過查詢的環節，但申請註冊之前，最好先做好查冊工作。日本特許廳在受理申請時不提供免費查詢，因此在註冊之前建議進行獨立的查詢。
4、 提交申請
填妥申請表格，並簽名或蓋章。為了讓申請順利進行，申請提交之前必須準備好所有資料。日本特許廳按類別區分（與中國相同，***同采用基於國際"尼斯協議"的"商品/服務國際區分表"），但就同壹商標同時註冊兩個以上類別的，新增加的類別在註冊文件費上可以享受優惠。
最重要是確定好商標註冊類別，選擇類別時，除了選擇自己經營業務的類別之外，還可以選擇壹些相關類別，防止別人利用其它類別來侵犯自己的知識產權，當然，也有些人把所有類別全部註冊，壹般來講，按國際標準劃分，商標分為45個類別。
日本特許廳受理申請後，會對是項申請進行初審，如果符合商標條例規定的標準，又沒有與以前申請個案重復或類同，是項申請就會進入公告階段。在公告期間，如果沒有遭到他人反對，拿到證書的勝算就很高了。
5、申請商標辦理流程：
（1）設計商標=》查詢》提交申請=》領取商標受理通知書=》初次審批=排版印刷=》刊登公告=》沒有異議=》正式批準=》領取證書=》10年後續期；
（2）設計商標=》查詢或查詢=》提交申請=》領取商標受理通知書=》駁回申請=》提出異議=》刊登公告=》遭到異議=》提出訴訟=》成功爭取或放棄申請。
6、申請商標時間
商標受理通知書約3個月交客戶，出證書時間15-20個月左右，商標證書有效期為10年，10年後再續展壹次就成為永久註冊。
百度百科-日本商標註冊申請程序