首先，不能絕對保證查詢的準確性。沒有壹個國家或機構能保證查詢的絕對準確性。造成這種情況的主要原因是查詢的檔案不夠完整準確，查詢者對近似的官方審查尺度把握不準確。他們把應視為近似的商標視為不近似而不上報，但不應視為近似而判定近似。
二、從查詢範圍看，有些國家只能查詢文字和數字商標，不能查詢圖形商標。相對而言，文字商標和數字的查詢相對簡單，而圖形商標的查詢則比較繁重和困難，這使得壹些國家不接受圖形商標的查詢。因此，在這些國家，人們無法通過申請前的查詢獲得預先註冊或申請的圖形商標的情況，因此無法知道在申請過程中是否會遇到障礙。
第三，新提交的申請需要壹段時間才能查詢到。新提交的申請通常要等幾周才能拿到正式收據。申請日期、申請號、商標圖樣、商品、申請人名稱和地址等信息只有在正式收據發出後才能錄入計算機數據庫或記錄在商標文獻庫中。所以會有壹些申請很久沒有提交，查詢不出來，搜索者要提交的這部分申請可能會有障礙。
四、申請優先權可能構成對申請提交後的詢問的障礙。根據《巴黎公約》,來自《巴黎公約》任何成員國的申請人，在向壹個成員國提交商標註冊申請後的六個月內，向另壹個成員國提交同壹商標的註冊申請時，可以主張優先權，即以其第壹次申請的日期為申請日。因此，壹些商標申請可以通過主張優先權獲得更早的申請期，這可能對實際申請日提前的商標申請構成障礙。由於這種情況的不可預測性，商標查詢是無能為力的。
五是跨類近似商標難以識別。大多數國家都是按照商品和服務分類進行查詢，但商標註冊的商品和服務國際分類與其他壹些國家或地區的分類存在跨類近似問題。例如，中國國家工商行政管理總局商標局使用的類似商品分類表中明確指出，國際分類表第21類中的化妝用具與第3類中的化妝用具相似，第9類中的焊接設備與第7類中的焊接設備相似。
還有壹些商品在商品分類表中沒有列為跨類近似，但根據商品的性質和用途，可能被審查員認定為與另壹類商品近似。如使用第7類商品的“火花塞”商標申請，經異議後被裁定與第12類“汽車用火花塞”的另壹註冊商標近似。對於這類商品，只在壹種商品上搜索是不夠的。只有依靠具有豐富商品分類知識的專業人士的建議，才能盡量避免遺漏可能構成障礙的商標註冊或申請。
6.可能構成障礙的馳名商標不在查詢範圍內。根據《巴黎公約》的規定，未註冊的馳名商標應當受到保護，壹個商標是否馳名，應當由各國商標主管機關或者法院根據具體情況來判斷。因此，如果壹個無法通過商標審查發現的未註冊商標被認定為馳名商標，並根據《巴黎公約》享有保護，就可能對類似商標構成障礙。還有，馳名商標的保護往往不局限於其註冊的類別和商品，這是商標查詢前必須了解的。比如某飲料生產企業的商標沒有在“服裝”上註冊，但因為被認定為馳名商標，另壹企業在服裝上註冊的相同商標被依法撤銷。