1、提供的材料不同：公司提供的是營業執照和對應的公章，個人提供的是個體執照和法人身份證；
2、商標歸屬權：個人註冊商標權歸個人所有，公司名義註冊商標權歸公司所有；
3、穩定性不同：以後公司變更，商標要相應做變更，而個人的身份證壹般是不變的，相對穩定；
4、所有權支配不同：個人註冊權限比較集中，公司註冊要由公司決定商標的使用情況。
商標的註冊流程如下：
1、提前設計好要註冊的商標；
2、確定商標的使用範圍；
3、提前查詢商標是否被註冊。到國家工商總局的網站上查詢該商標是否被人註冊，如果被註冊了就要更改商標後再提交。沒有註冊即可提交註冊申請；
4、到所在地的工商局提交資料。個人註冊商標需要提交身份證復印件正反面各2張、商標的設計圖案6張、帶本人簽名的商標註冊申請書；
5、等待商標局的審核；
6、公示期。通過了商標局的初審後，即進入3個月的公示期，任何人有異議的都可以提出，如果沒有異議的即可以成功註冊。有異議的要進行商標異議答辯，答辯通過後即可成功註冊；
7、商標的公布。通過了公示期後，商標局會發文公布該商標成功註冊，即可以使用，此時商標即受法律保護。
綜上所述，自然人、法人或者其他組織對其生產、制造、加工、揀選或經銷的商品或者提供的服務需要取得商標專用權的，應當依法向國家工商行政管理總局商標局（以下簡稱商標局）提出商標註冊申請。
法律依據：
《中華人民***和國商標法》第二十八條
對申請註冊的商標，商標局應當自收到商標註冊申請文件之日起九個月內審查完畢，符合本法有關規定的，予以初步審定公告。