除此外申請人的所屬國和日本已經簽訂有關商標掩護的雙邊協議，申請人的所屬國和日本有互惠原則，註冊日本商標須要的材質，如果以法人申請的，須要附上《營業執照》或者有效登記證明復印件加蓋公章壹份，以自然人申請的則須要附上個人身份證明文件壹件。
還須要申請人詳細的信息，包含申請人的姓名、地址、接洽方法和國籍、商標圖片、商品的名稱和類別等文件，在滿足以上申請日本商標的條件及所需資料後，就可以直接進入申請日本商標的步驟了。
日本商標註冊流程的第壹步就是提交申請書，申請人必需填寫相幹法律規定的表格，然後提交到日本專利局，官方受理後會有電子惠子文檔，內容包含申請信息、申請日和申請號，日本專利局審查提交的申請文件是否符合程序和情勢的請求，如果提交的文件沒有滿足必要的請求，將會湧現駁回請求重新修改的情形，這是日本商標註冊流程中第壹次湧現駁回的情形。
然後日本專利局審查提交的審查內容是否符合本質性請求，本質審查後，凡有申請不符合本質性請求，日本專利局將發送說明駁回理由的通知，申請人可以針對駁回的理由，在3個月內提交書面看法或者修訂內容，如果最終判定沒有任何駁回的理由，將準予商標註冊。
如果申請人提交的書面看法或修訂不足以清除駁回理由，並且日本專利局工作人員審定該標識不合適註冊為商標，則謝絕註冊，當對謝絕的決議不服時，當事人可以在駁回決議發出3個月內要求復審，審查由3－5名復審委員會成員進行，在復審審查中，如果駁回的理由被消除則贊成註冊，如果駁回的理由仍然存在，則持續履行駁回註冊的決議，通過後即可成功日本商標的註冊。