蛇口碼頭1
蛇口客運站建於1981。2016 10 10月30日，蛇口客運站正式停運。結束了35年的客運服務。蛇口客運碼頭業務移至蛇口郵輪中心。10 10月31日，蛇口郵輪中心正式對外營業，市民可在此乘船前往香港、澳門、珠海。
2.福永碼頭
深圳機場碼頭(原名福永碼頭/深圳機場福永碼頭)，英文名:ShenzhenAirportFerryTerminal，位於深圳寶安國際機場西南部，距T3航站樓僅2公裏。
3.鹽田碼頭
鹽田港是中國廣東省深圳市的壹個港口，位於深圳南部的大鵬灣北岸，西鄰沙頭角，西北有24公裏鐵路到達深圳，東接惠州72公裏，南接小梅沙。
4.赤灣碼頭
赤灣港位於深圳經濟特區西部南頭半島頂端，珠江口東岸，距香港20海裏。距離珠海、澳門50海裏，水陸距離廣州約150公裏。
5.媽灣碼頭
深圳媽灣港區主要有海星港務發展有限公司、深圳樂毅液體倉儲倉儲有限公司、深圳月亮灣油港有限公司、南油港倉儲發展有限公司、深圳滬星拖輪有限公司、深圳能源港有限公司等。其主要業務是大宗商品、液體化工產品、石油產品和煤炭。