本公司成立於1994年5月9日，為股份有限公司，在武漢市工商行政管理局註冊。公司前身為武漢第三制藥廠，經武漢市經濟體制改革委員會“武體改[1993]189號”批準，以定向募集方式設立。2004年3月20日，經中國證券監督管理委員會《關於核準武漢馬應龍醫藥集團股份有限公司公開發行股票的通知》(證監許可字[2004]40號)核準，於2004年5月17日在上海證券交易所上市。本公司經2007年度股東大會審議通過，於2008年5月6日由“武漢馬應龍醫藥集團股份有限公司”更名為“馬應龍醫藥集團股份有限公司”。