菏澤堯舜牡丹生物科技有限公司依托菏澤豐富的牡丹資源，堅持以科技為先導，以推進油用牡丹標準化種植、精深加工和牡丹資源綜合利用為主線，逐步推進牡丹產業化發展。公司下設科技研發部、工程部(基地建設部)、市場開發部、文化部、項目部、生產部、質量管理部、財務部、人力資源部(勞動部)、後勤保障部、辦公室等機構。
位於菏澤市的菏澤堯舜牡丹生物科技有限公司的母公司山東宏業集團有限公司，是集石油化工、煤化工、醫藥制造、建築、房地產為壹體的多元化大型民營企業集團。宏業集團下轄宏業化工集團、方明化工集團、方明醫藥集團、紅丹集團和方明建設集團。2011年，公司實現銷售收入10多億元，實現利稅12億元，是菏澤市的支柱產業，為地方經濟發展做出了突出貢獻。