1.余額寶可以存零錢，也可以隨時取。金元寶1000元起存，最低投資期限6天。
2.不同的理財產品有不同的年化收益率。
3.平臺後臺不壹樣。余額寶的後臺是支付寶和田弘基金公司，金元寶的後臺是高淳財富集團。
4.第三方支付渠道不同。余額寶通過支付寶支付，金元寶通過央行發放支付牌照。
擴展數據:
如今，余額寶不僅是國民理財的“神器”，還不斷進入各種消費場景，給用戶帶來潛移默化的美好變化。從2014開始，余額寶陸續推出零元買手機、余額寶買車等項目，讓余額寶用戶享受到特別優惠的權益，也看到了余額寶在消費領域的想象空間。
到2015年3月，余額寶第壹個買房，這是余額寶消費場景的壹大突破，也是房地產行業第壹次引入互聯網金融工具。
當時，方興地產聯合淘寶推出余額寶購房項目，發布1132套房源，支持余額寶在北京、上海、南京等全國十大城市購房:購房者通過淘寶支付首付後，首付將被凍結在余額寶內。正式交房前或首付後3個月，首付產生的余額寶收益仍歸買方所有。這意味著先發貨再付款，先付款也能獲得收益。
百度百科-余額寶