1，研究領域不同。中電54主要從事電力電子、新能源發電及控制研究；鐵道科學研究所主要研究鐵路相關技術，如高鐵、城際鐵路等。
2.行業屬性不同。中電54屬於電力行業，研發技術主要服務於電網企業；鐵道研究所屬於鐵路行業，服務於全國鐵路系統。
3.不同的組織體系。中電54所隸屬於中國電力專業公司，鐵道科學研究院隸屬於中國鐵路總公司。
4.研究方向不壹樣。中電54所的研究方向有所側重，鐵道研究所的研究範圍更廣，涉及動車組、高鐵技術、通信信號等多個領域。