1.華仁藥業是亳州藥都的企業，成立於1994，主要生產銷售中藥飲片和中藥保健品。目前，該公司已成為安徽省最大的中藥飲片生產商之壹和中國最大的中藥飲片出口商之壹。
2.安徽天元藥業股份有限公司也是亳州藥都的企業之壹。成立於1996，主要從事中藥制劑的生產和銷售。公司生產的產品包括中藥提取物、中藥飲片等。，其中最著名的產品是“天元牌參茸保健品”。
3.安徽中恒藥業股份有限公司，成立於2000年，是亳州藥都的制藥企業，主要從事中藥散劑、膠囊、顆粒劑的研發和生產。目前公司擁有壹系列具有自主知識產權的藥品，其中最著名的產品是“中恒感冒靈顆粒”。