哈藥集團生物工程有限公司是哈藥集團的全資子公司，哈藥集團是哈爾濱市國資委監管的地方國有企業，所以哈爾濱地方國有資本對哈藥集團生物工程有限公司擁有最終控制權，該企業應視為哈爾濱地方國有企業。
但是，哈藥集團本身已經完成了股份制改革。哈爾濱的國有資產之外，還有非國有股東，所以不是國有獨資企業，而是國有資產控股的國有股份制企業。對應的哈藥集團生物工程有限公司不是國有獨資企業，但不影響國有資產的控股地位。