二期工程於2009年9月順利投產，日加工煤炭1.7萬噸；壹氧化碳30萬噸/年；氫氣21000 nm3/h；/h；合成氣11000 nm3/h；甲醇65438萬噸/年；2010實際開工率99.5%；硫化物排放幾乎為零。
經過短短兩年的發展，以匯生能源潔凈煤裝置為龍頭，與南京化工園區下遊客戶共同開發了多條高附加值產業鏈，匯生能源潔凈煤裝置成為實施“循環經濟”的典範。
2011年，匯生能源已開工三個項目，包括:30萬噸/年MTO擴能項目、與殼牌合作的新型煤氣化示範項目、25萬噸/年丁辛醇項目、3.5萬噸/年煤制氫項目；預計2013投產。